Het onderzoek is ondergebracht in drie wiskundeafdelingen, te weten:
Algebra & Logica
Mathematische Fysica
Toegepaste Stochastiek
Deze afdelingen maken deel uit van het onderzoekinstituut IMAPP.
Onderzoekresultaten zijn veelal digitaal te verkrijgen bij de Radboud Repository.
Het MRI
Het Mathematisch Research Instituut is een samenwerkingsverband tussen wiskundevakgroepen van de universiteiten van Groningen, Nijmegen, Twente en Utrecht. De doelstelling is het bevorderen van wiskundig onderzoek, het organiseren van cursussen en seminaria voor aio's, en het stimuleren van internationale contacten en uitwisselingen. Het MRI is een van de belangrijkste wiskundige instituten in ons land en organiseert jaarlijks een Master Class waaraan ook studenten kunnen deelnemen.