Ervaringen
De kleine klassen zorgen voor interactieve colleges en een open omgeving waarin iedereen vrij is om vragen te stellen en deel te nemen.
- Vooropleiding
- Bachelor Biologie
- Opleiding
- Medical Epigenomics
Wat vind je leuk aan de master en waarom?
Ik geniet ervan dat de master echt laat zien hoe modern biologisch onderzoek wordt uitgevoerd. Docenten praten enthousiast over hun onderzoek tijdens colleges en tijdens stages kun je eraan deelnemen.
Hoe vind je de sfeer in de klas?
De kleine klassen zorgen voor interactieve colleges en een open omgeving waarin iedereen vrij is om vragen te stellen en deel te nemen.
Hoe heeft de master je uitgedaagd?
Dit programma heeft me uitgedaagd om vaardigheden zoals programmeren te leren, waar ik weinig ervaring mee had. Het daagt je ook uit als wetenschapper om kritisch te zijn op je eigen onderzoek en verantwoordelijkheid te nemen voor je projecten.
Hoe is de begeleiding binnen de studie?
Iedereen krijgt tijdens het programma een eigen begeleider, met wie je verschillende contactmomenten hebt. Daarnaast staat de studieadviseur altijd klaar om je te helpen bij eventuele onzekerheden.
Wat zijn je plannen nadat je je diploma hebt behaald?
Als ik klaar ben wil ik de bio-informatica kennis die ik heb opgedaan in dit programma gebruiken in een academische of zakelijke omgeving.
Waarom heb je gekozen voor de Radboud Universiteit?
Radboud Universiteit bood een programma dat aansloot bij mijn interesses op dit gebied, samen met het feit dat je twee stages kunt doen. Dit heeft mij veel praktische ervaring opgeleverd in hoe je onderzoek kunt doen.
Wat vind je leuk aan Nijmegen?
Nijmegen is een leuke, levendige studentenstad waar ik na mijn bachelor niet weg wilde. De ontspannen sfeer is iets wat ik niet kon missen.
Welke informatieactiviteiten vind je waardevol en waarom?
Tijdens de open dag kun je met studenten praten over de meer praktische aspecten van de studie. Om echt te ervaren hoe het programma is, is het essentieel om een dag met een student mee te lopen.
Wat zou je studenten adviseren bij het kiezen van studie?
Het organiseren en plannen van je masterprogramma en stages vergt verantwoordelijkheid. De grote vrijheid die je hier krijgt, vereist ook veel initiatief van elke student.
Met integratieve omics-technieken probeer ik de genregulatie in malariaparasieten te begrijpen, wat in de toekomst hopelijk zal leiden tot betere bestrijdingsstrategieën.
- Opleiding
- Medical Epigenomics
Kun je jezelf voorstellen?
Ik ben Richard Bartfai, de coördinator van de specialisatie Medische Epigenomica. Ik ben vanaf het begin betrokken geweest bij deze specialisatie en geef les in de cursussen Integrative Omics in Health and Disease, en Data Visualisation.
Waarom heb je ervoor gekozen om in dit vakgebied te gaan studeren/werken? Wat maakt dit vakgebied zo interessant?
Medical Epigenomics fascineert me omdat het verschillende high-throughput technologieën integreert met computationele en biomoleculaire benaderingen om een globaal inzicht te bieden in genregulatie binnen de context van ontwikkeling, gezondheid en ziekte.
Waar doe je momenteel zelf onderzoek naar?
Met integrative omics technieken probeer ik te begrijpen hoe malariaparasieten gen-regulerende mechanismen inzetten om zich aan te passen aan en te overleven in hun menselijke gastheer. Ik ben ervan overtuigd dat deze kennis uiteindelijk zal helpen om betere strategieën voor de bestrijding en eliminatie van malaria te ontwikkelen.
Welke tip heb je voor studenten die hun studiekeuze gaan maken?
Ik adviseer studenten altijd om na te denken over wat voor soort baan ze zouden willen hebben na hun studie en de studie te kiezen die hen het beste voorbereidt op dit carrièrepad. En als je het nog niet weet, kies dan een studie met een onderwerp dat je fascineert, dan ben je in ieder geval op de juiste weg.
Wat is het mooiste aan het docentschap?
Het is enorm bevredigend om te zien hoe studenten zich ontwikkelen tot jonge professionals en hun eigen weg in het leven vinden. Als docenten doen we ons uiterste best om de persoonlijke en professionele ontwikkeling van studenten te ondersteunen in dit proces.
Ik vind het met name interessant te werken op het snijvlak van biologie en datawetenschap.
- Opleiding
- Medical Epigenomics
Rebecca Snabel promoveert eind van dit jaar bij Moleculaire Ontwikkelingsbiologie van de Radboud Universiteit Nijmegen. ‘Ik ben opgeleid als bioloog met als specialisatie medische epigenetica. Hierbij leer je veel over moleculaire biologie en maak je kennis met bio-informatica. Mijn promotieonderzoek bouwt verder op mijn masterstudie en leert mij werken met big data.’
Menselijke stamcellen
De promovenda focust op menselijke stamcellen, waaruit hartspiercellen worden gekweekt. ‘Een collega op de Universiteit Twente kweekt de stamcellen op tot hartspiercellen. Die hartspiercellen ‘verpakt’ ze in buisjes. In elk buisje doet ze één cel. Zo verzamelt ze ongeveer vierhonderd buisjes op een plaat’, verklaart Rebecca Snabel.
Aangezien de hartspiercellen op min 80 graden Celsius gehouden worden, worden ze op droogijs, via een speciale koerier van de Universiteit Twente naar de Radboud Universiteit verzonden. ‘Ik pak de cellen in het laboratorium uit voor verder onderzoek en werk zoveel mogelijk op ijs’, vertelt Rebecca Snabel.
‘Mijn eerste stap is vloeistof toevoegen aan elke cel apart. Dat doe ik met een pipeteerrobot, die ik via de computer instel. Het luistert namelijk heel nauw hoeveel vloeistof je toevoegt. Door de vloeistof klapt de cel open en kan ik mijn onderzoek beginnen.’
Cellen met specifieke functies
‘Het is belangrijk om over een langere periode te kijken hoe de cellen zich ontwikkelen’, benadrukt Rebecca Snabel. Ze zoomt uit om het begrijpelijk te maken: ‘In ons lichaam zitten cellen met verschillende functies, maar het DNA van al onze cellen is hetzelfde!
Eenvoudig gezegd is RNA de tussenstap om van genen op het DNA tot eiwitten te komen, die allerlei verschillende taken vervullen. Zo ontstaan dus binnen cellen specifieke functies. Groepen van verschillende cellen ontwikkelen zich tot een orgaan, zoals het hart, de lever, longen enzovoorts. Met moleculaire technieken analyseer ik voor elke hartspiercel apart hoe die functieontwikkeling in zijn werk gaat.’
Statistische programma’s
‘Uit één enkele cel kunnen wij tot wel drieduizend verschillende RNA’s tellen’, vervolgt Rebecca Snabel. ‘Met statistische programma’s op de computer maak ik van die gegevens tabellen, waarin de cellen een profiel krijgen. Dat is pure data-analyse. Naast mijn eigen data gebruik ik ook datasets van andere onderzoekers, met bijvoorbeeld hartspierweefsel uit muizen.’
Snijvlak biologie en datawetenschap
Naast haar onderzoek begeleidt Rebecca Snabel studenten tijdens hun stage en assisteert ze bij practica-colleges in het laboratorium. ‘De meeste tijd werk ik aan het beeldscherm, want data-analyse is een groot onderdeel van mijn project.
Ik vind het met name interessant te werken op het snijvlak van biologie en datawetenschap. Dat wil ik ook na mijn promotie blijven doen. Fundamentele wetenschap, maar met zicht op praktische toepassing. Mijn onderzoek draagt pure kennis bij, maar leidt ook tot medische toepassingen in de toekomst. Bijvoorbeeld om mensen met hartziekten beter te kunnen helpen.’
Gepubliceerd op TechGelderland