Na afloop van de cursus kan de student:
- methoden van de bioinformatica in de praktijk toe te passen op biologische, (bio)chemische en biomedische vraagstukken.
- bioinformatica databases bevragen via het WWW.
- gevonden eiwitsequenties analyseren, er een (multiple) sequentie alignment mee maken en hiermee kun je trefzeker, weloverwogen en wetenschappelijk verantwoord eigenschappen van het ene eiwit afleiden uit reeds bekende eigenschappen van andere eiwitten.
- de kennis van de speciale eigenschappen van aminozuren en de wijze waarop die eiwiteigenschappen bepalen toepassen op biologische, (bio)chemische en biomedische vraagstukken
- de secundaire structuur van eiwitten voorspellen en deze gebruiken bij het oplossen van eiwit sequentie gerelateerde vraagstukken.
- deelnemen aan de vervolgcursussen: Structure, Function, Bioinformatics (MOL066) (over macromolecular structures), Comparative Genomics (MOL073) (over genomics) and Chemical Discovery and Design (CMBI101B).
|
|
- Gebruik van databases en database search software. Gedegen kennis van de aminozuren, hun fysisch/chemische eigenschappen, en de relatie tussen deze eigenschappen en de structuur en functie van het hele eiwit.
- Begrip van de significantie van sequentie vergelijkingsresultaten.
- Secundaire structuur voorspelling en het gebruik van de voorspelde secundaire structuur bij het oplossen van eiwit sequentie gerelateerde vraagstukken.
- Multiple sequentie alignment software gebruik en interpretatie van resultaten.
- Gebruik van gedetecteerde sequentie homologen, en (sequentie) databases en bijbehorende software om informatie over een nog ongekarakteriseerd eiwit te verzamelen.
|
|